L'attività svolta in ambito faunistico prevede l'allevamento, la reintroduzione, il censimento, la cura e il ricovero di animali selvatici.
Anche su National Geographic si parla del progetto per la reintroduzione del cervo sardo In un recente articolo del periodico italiano collegato alla National Geographic Society, una delle maggiori istituzioni non profit al mondo nel campo delle scienze naturali e della fotografia naturalistica, si parla diffusamente della reintroduzione del cervo sardo portata avanti dall'Ente Foreste e dai partner del progetto finanziato in ambito europeo (LIFE+)
Un allevamento di mufloni a scopo di studio e ripopolamento L’Ente Foreste della Sardegna ha intrapreso la gestione di un centro di riproduzione di mufloni nel recinto di Curadureddu (Monte Limbara Nord) nell'ambito di un progetto finalizzato alla reintroduzione del muflone sul Monte Limbara, con la possibilità di visite didattiche in un'area attrezzata.
Censimento del muflone: report 2015 L'annuale censimento del muflone in Sardegna, condotto sui territori gestiti dall'Ente Foreste, è un importante strumento per monitorare e gestire la distribuzione di questa specie. Nei risultati vengono evidenziati il rapporto numerico tra i due sessi e la prolificità.
Censimento del daino: report 2015 Anche quest'anno è stato condotto il censimento del daino all’interno delle aree gestite dall’Ente Foreste, con il fine di monitorare e quindi gestire le diverse popolazioni di questo importante ungulato della Sardegna